Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MADCAM1Q13477 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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