Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCOCO2Q13137 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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