Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIAQ12857 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIAQ12857 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
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