Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp4r2Q0VGB7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms