Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h18Q0P678 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms