Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pate4Q09098 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms