Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MestQ07646 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MestQ07646 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MestQ07646 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MestQ07646 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MestQ07646 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MestQ07646 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MestQ07646 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MestQ07646 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MestQ07646 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MestQ07646 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms