Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNEQ04844 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNEQ04844 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms