Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn6Q03958 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn6Q03958 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn6Q03958 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms