Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Epha4Q03137 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Epha4Q03137 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 507.8 ms