Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkczQ02956 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrkczQ02956 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms