Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax5Q02650 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax5Q02650 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms