Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr1fQ02284 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr1fQ02284 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr1fQ02284 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms