Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK5Q00535 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK5Q00535 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms