Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM3AP98173 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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FAM3AP98173 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM3AP98173 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3AP98173 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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