Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp6P97868 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbbp6P97868 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms