Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bop1P97452 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms