Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp1P97350 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkp1P97350 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms