Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnikP83510 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TnikP83510 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TnikP83510 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TnikP83510 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnikP83510 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnikP83510 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnikP83510 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnikP83510 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnikP83510 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnikP83510 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnikP83510 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TnikP83510 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnikP83510 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnikP83510 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnikP83510 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TnikP83510 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TnikP83510 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TnikP83510 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnikP83510 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnikP83510 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnikP83510 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnikP83510 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnikP83510 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnikP83510 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnikP83510 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnikP83510 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TnikP83510 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TnikP83510 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TnikP83510 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TnikP83510 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnikP83510 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnikP83510 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TnikP83510 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TnikP83510 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TnikP83510 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnikP83510 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnikP83510 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnikP83510 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnikP83510 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnikP83510 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnikP83510 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnikP83510 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnikP83510 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnikP83510 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TnikP83510 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnikP83510 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms