Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX5P78411 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX5P78411 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX5P78411 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX5P78411 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX5P78411 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX5P78411 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX5P78411 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX5P78411 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX5P78411 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX5P78411 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX5P78411 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX5P78411 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX5P78411 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX5P78411 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX5P78411 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX5P78411 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms