Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX1P67809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX1P67809 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX1P67809 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX1P67809 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX1P67809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX1P67809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX1P67809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX1P67809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX1P67809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1588.4 ms