Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB1P62873 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB1P62873 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms