Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL23P62829 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL23P62829 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL23P62829 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL23P62829 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL23P62829 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL23P62829 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL23P62829 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL23P62829 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL23P62829 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL23P62829 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms