Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps11P62281 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms