Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2mP61082 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2mP61082 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2mP61082 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms