Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap25P60879 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap25P60879 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap25P60879 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap25P60879 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms