Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samsn1P57725 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samsn1P57725 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms