Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bace1P56818 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bace1P56818 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms