Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c38P56655 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c38P56655 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c38P56655 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms