Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP2S1P53680 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms