Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3M2P53677 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3M2P53677 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms