Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBA4P53673 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYBA4P53673 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms