Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upp1P52624 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upp1P52624 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms