Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP5P51878 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP5P51878 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP5P51878 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP5P51878 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP5P51878 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP5P51878 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP5P51878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP5P51878 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP5P51878 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP5P51878 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP5P51878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP5P51878 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP5P51878 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASP5P51878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP5P51878 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP5P51878 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP5P51878 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP5P51878 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP5P51878 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms