Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms