Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms