Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epb41P48193 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Epb41P48193 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Epb41P48193 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms