Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nedd4P46935 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nedd4P46935 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nedd4P46935 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms