Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf1P46099 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms