Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-5P42582 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms