Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA3P42263 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms