Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd27P41272 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd27P41272 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms