Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps26aP40336 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps26aP40336 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms