Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd1P40201 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Chd1P40201 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Chd1P40201 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Chd1P40201 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd1P40201 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd1P40201 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd1P40201 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Chd1P40201 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Chd1P40201 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Chd1P40201 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Chd1P40201 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms