Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fen1P39749 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fen1P39749 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms