Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upk2P38575 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Upk2P38575 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms