Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acvr1P37172 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acvr1P37172 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms