Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab20P35295 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab20P35295 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab20P35295 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms