Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab21P35282 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab21P35282 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab21P35282 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms