Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SsbP32067 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SsbP32067 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SsbP32067 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SsbP32067 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SsbP32067 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SsbP32067 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SsbP32067 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SsbP32067 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SsbP32067 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SsbP32067 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SsbP32067 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SsbP32067 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SsbP32067 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SsbP32067 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms